Projek MyGenom adalah kerjasama antara-kementerian, terutamanya antara Kementerian Sains, Teknologi dan Inovasi (MOSTI) dan Kementerian Kesihatan (KKM). Pasukan projek pelaksana adalah dari National Institutes of Biotechnology Malaysia (NIBM) untuk MOSTI, dan Institut Kesihatan Negara (NIH) untuk KKM.